:/基準ページを含む所にだけリンク

基準ページというものは実装しないので、これは不可能。

リンクしすぎなら基準ページにだけリンクするオプションを。その他のページは基準ページと1つになって表示される。
これでPukiWikiと同じ自動リンクに。フルパスが必要になる。