記法→要素→別の記法
…という使い方をしても、記法→要素→同じ記法と同じ。問題なし。
ただ独自定義の記法で、要素を作ってから記法定義を変えた場合に衝突する可能性ありというかそれは運用の問題

記法定義を変えるのはサイト内の全ページを一括置き換えするのと似たようなもの。


記法定義を変えても要素→記法には影響しない。入力したときのNotationText編集対象になる。
問題が起きるのは再投稿時。意図した通りに解釈されないかも知れない。でも解釈が変わっても/何度投稿してもNotationTextはそのまま残るので情報が失われることは無い。NotationTextで見れば何の変化も無し。

記法が十分に要素化できていて、要素から記法への変換も余すところなくできていれば問題なし。変換を重ねることに問題は無くて、個々の変換が正しくできるかどうかが問題。